生物学：生物信息学在线测试（考试必看）

时间:2020-01-27 02:00:56

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1、名词解释  BLAST


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2、名词解释  马尔可夫链


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3、单项选择题  Entrez数据库中的剪贴板的容量是（）。

A.500条记录
B.1000条记录
C.5000条记录
D.10000条记录


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4、多项选择题  最常用的序列相似性查询工具是（）

A.FASTA
B.BLAST
C.SWISS-PROT
D.PDB
E.PIR


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5、名词解释  RefSeq


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6、多项选择题  下列哪些分子类型属于非蛋白质编码区（）

A.内含子
B.卫星DNA
C.伪基因
D.启动子
E.增强子


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7、名词解释  近邻


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8、问答题  如何处理BLAST后过少或过多的结果？


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9、单项选择题  隐马尔科夫模型的代号是（）。

A.HMM
B.CDD
C.HTGS
D.GSS


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10、单项选择题  SAGE的含义是（）。

A.基因表达连续分析
B.聚丙烯酰胺凝胶电泳
C.基因组分析
D.双向电泳分析


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11、单项选择题  GenBank中分类码PLN表示是（）。

A.哺乳类序列
B.细菌序列
C.噬菌体序列
D.植物、真菌和藻类序列


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12、问答题  序列分析的任务和目的分别是什么？


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13、多项选择题  下面序列哪些为反向重复序列（）

A.…GCACTTG…GCACTTG…
B.…GCACTTGCAAGTGC…；…CGTGAAC…CGTGAAC…；…CGTGAACGTTCACG…
C.…GCACTTG…CAAGTGC…
D.…GCACTAGCTAGCGG…；…CGTGAAC…GTTCACG…；…CGTGATCGATCGCC…


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14、名词解释  ESI电喷雾离子化


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15、单项选择题  NCBI中人类无冗余基因数据库是（）。

A.UniGene
B.UniPro
C.UniRef
D.URF


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16、问答题  引物设计的基本原则有哪些，有哪些基本参数要考虑，最常用的引物设计软件是什么？


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17、名词解释  linux operating system


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18、名词解释  BioEdit


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19、名词解释  Clustsl X


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20、名词解释  gene tree


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21、名词解释  MMDB(Molecular Modeling Database)


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22、多项选择题  真核基因组特点包括（）

A.基因组大，巨大的非编码序列，重复序列占了绝大部分
B.基因结构复杂，无显著长度的开放阅读框
C.存在可变剪接
D.CpG岛
E.等值区


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23、问答题  简述生物类的数据库类别分为有哪两种及其定义


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24、单项选择题  accession number的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推


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25、问答题  假设你得到一段未知蛋白的氨基酸序列，从你学习到的生物信息学分析方法和软件，设计一个分析流程来分析该未知蛋白的功能和家族类别以及其结构预测。


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26、问答题  生物信息学主要研究内容。


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27、名词解释  一致序列


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28、名词解释  支架


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29、多项选择题  RFLP是DNA多态性中最多见的一种，它产生的机制包括（）

A.DNA分子产生突变，使某些酶切位点数增加
B.DNA分子产生突变，使某些酶切位点数减少
C.限制性酶切位点之间重复序列数目变异
D.限制性酶星活性
E.限制性酶切位点前后的DNA片断发生插入或删除


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30、名词解释  模块替换矩阵（BLUSUM）


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31、单项选择题  ORF的含义是（）。

A.调控区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框


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32、名词解释  PDB（Protein Data Bank）


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33、名词解释  分子进化树（molecular evolutionary tree）


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34、名词解释  SWLSS—MODE


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35、问答题  简述构建进化树的步骤，每一步列举1-2种使用的软件或统计学方法。


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36、名词解释  标度树（scaled tree）


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37、问答题  什么简约信息位点Pi？


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38、名词解释  基因预测（geneprediction）


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39、名词解释  密码子偏好性（codon bias）


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40、填空题  2-DE的基本原理是根据蛋白质（）和（）不同，进行两次电泳将之分离。第一向是（），第二向是（）。


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41、名词解释  先导化合物


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42、名词解释  maximum parsimony method


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43、问答题  生物信息学的发展经历了哪几个阶段


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44、名词解释  距离法


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45、名词解释  空位罚分


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46、问答题  BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么？


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47、单项选择题  单核苷酸标记是（）。

A.RFLP
B.SNP
C.SSR
D.RAPD


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48、问答题  生物信息学研究有什么意义？


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49、单项选择题  motif的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域


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50、名词解释  顺式调控元件


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51、问答题  相比使用BLAST套件搜索数据库，BLAST2工具在结果呈现上有什么优点？


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52、问答题  什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么


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53、问答题  生物信息学研究意义？


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54、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“Cancer epigenetics: from mechanism to therapy”作者的单位是（）。

A.University of California
B.University of Columbia
C.University of Cambridge
D.University of Chicago


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55、单项选择题  基本局部比对搜素工具是（）。

A.Mega
B.ClustalW
C.BLAST
D.GCG


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56、问答题  什么是动态规划算法？


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57、问答题  什么是物种的标记序列？


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58、问答题  什么事件大大促进了生物信息学的发展？


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59、问答题  序列比对分类有哪些？


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60、单项选择题  algorithm的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推


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61、单项选择题  UTR的含义是（）。

A.编码区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.开放阅读框


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62、名词解释  非信息位点


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63、名词解释  折叠识别法


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64、名词解释  折叠子（Fold）


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65、单项选择题  basepair的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域


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66、名词解释  EST


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67、名词解释  标度树


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68、问答题  如何选择合适的评分矩阵？


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69、单项选择题  EMBL的含义是（）。

A.美国国家生物信息中心
B.欧洲分子生物学实验室
C.日本DNA数据库
D.中国国家基因组研究中心


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70、名词解释  二级数据库


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71、问答题  TSS，外显子和内含子的概念。


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72、问答题  GBFF格式的特性表格式包括哪三个部分？


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73、名词解释  molecular phylogenetic tree


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74、名词解释  蛋白质组（proteome）


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75、填空题  目前由NCBI维护的大型文献资源是（）


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76、问答题  简述GenBank数据库中GBFF格式的结构？


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77、问答题  你认为，什么是生物信息学？


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78、名词解释  简约信息位点


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79、单项选择题  GenBank数据库的基本信息单位是（）。

A.FASTA
B.GBFF
C.GCG
D.ASN.1


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80、问答题  简述最大简约法（MP）的算法思想。


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81、问答题  简述人类基因组研究计划的历程。


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82、名词解释  信息位点


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83、填空题  序列比对的基本思想，是找出（）和（）的相似性，就是通过在序列中插入（）的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是（）和（）。


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84、名词解释  structure domain


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85、问答题  生物信息学数据库的组成包括哪些部分？数据库有哪些类型？


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86、问答题  预测基因的一般步骤是什么？


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87、名词解释  外类群


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88、多项选择题  20世纪三大著名计划包括（）

A.阿波罗登月计划
B.卫星计划
C.HGP
D.肿瘤计划
E.曼哈顿原子弹计划


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89、单项选择题  蛋白质基序（motif）中[ST]的含义是（）。

A.氨基酸为ST
B.氨基酸为S和T
C.氨基酸为S或T
D.除掉S和T之外的任意氨基酸


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90、名词解释  算法（algorithm）


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91、名词解释  最佳联配（optimal alignment）


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92、名词解释  PROSITE


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93、问答题  生物信息学在基因芯片中的应用有哪些？


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94、问答题  试述PSI-BLAST搜索的5个步骤。


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95、单项选择题  没有直接参与完成人类基因组计划的国家是（）。

A.英国
B.中国
C.俄罗斯
D.德国


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96、名词解释  多序列比对


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97、问答题  简要介绍GenBank中的DNA序列格式。


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98、问答题  假设你得到一段未知基因的DNA序列，从你学习到的生物信息学分析方法和软件，设计一个分析流程来分析该未知基因的功能和家族类别（包括系统发育树构建）


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99、单项选择题  STS的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列


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100、名词解释  FASTA序列格式


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101、名词解释  空位罚分


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102、名词解释  miRNA


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103、名词解释  同源性


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104、问答题  什么是序列比对？及其基本分类？


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105、名词解释  ORF


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106、多项选择题  人类基因组计划要完成的几张图谱分别是（）

A.物理图谱
B.遗传图谱
C.序列图谱
D.生物图谱
E.基因图谱


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107、问答题  什么是多序列全局比对的累进算法？（三个步骤）


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108、单项选择题  多序列比对工具是（）。

A.BLAST
B.ClustalW
C.Mega
D.GCG


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109、名词解释  序列模式（Motif）


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110、名词解释  虚拟细胞


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111、问答题  我国自主知识产权的主要基因组测序计划有哪些？


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112、问答题  为什么蛋白质空间结构预测很重要，目前有哪几条途径用于从蛋白质的氨基酸序列预测其空间三维结构？


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113、名词解释  Gene Ontology 协会


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114、填空题  通过比较建模预测蛋白质结构的软件有（）（SWISS—MODEL网站）


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115、名词解释  有根树


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116、问答题  简述DNA计算机的基本原理


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117、问答题  先导化合物的来源有四种来源


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118、问答题  简述人类基因组计划与生物信息学之间的相互促进关系。


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119、单项选择题  HTGS的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列


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120、问答题  国际上权威的核酸序列数据库有那些？


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121、名词解释  空位（gap）


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122、单项选择题  生物芯片分析中使用的聚类分析输出图形主要以下列哪种方式表现？（）

A.以彩色小方块阵列表示
B.以蜂窝形状表示
C.以黑白圆点表示
D.以彩色线条表示


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123、单项选择题  根据大量EST具有相互重叠的性质，通过计算机算法获得cDNA全长序列，这种克隆基因的方法是（）。

A.重叠克隆
B.电子克隆
C.基因步移
D.基因重组


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124、名词解释  系统生物学（systems biology）


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125、问答题  生物信息学分析的数据对象主要有哪几种？这些数据之间存在着什么关系？


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126、填空题  分子途径最广泛数据库：（）


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127、问答题  系统发育树的构建步骤是什么？


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128、名词解释  比较基因组学


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129、问答题  指出下列特殊标识符的格式？


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130、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“Transgenic plants of Petunia hybrida harboring the CYP2E1 gene efficiently remove benzene and toluene pollutants and improve resistance to formaldehyde”的第一作者是（）。

A.XiangT
B.BaoL
C.LiP
D.ZhangD


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131、名词解释  BLOSUM矩阵


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132、问答题  序列的相似性与同源性有什么区别与联系？


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133、单项选择题  analogy的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推


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134、填空题  （）和（）中的注释所涉及的问题是不同的


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135、问答题  如何用BLAST发现新基因？


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136、问答题  在MEGA2软件中，提供了哪些碱基替换距离模型，试列举其中3种，解释其含义。


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137、填空题  系统发育树的构建方法：（）


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138、填空题  初级序列数据库：（）


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139、单项选择题  CDS的含义是（）。

A.编码区
B.非编码区
C.低复杂度区域
D.非调控区


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140、单项选择题  在真核生物中，一个基因cDNA的5′端起始密码子AUG的前后序列符合（）规则。

A.Kozak
B.AU…AG
C.SD
D.Poly（A）n


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141、问答题  简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系


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142、单项选择题  GenBank数据库中的登录号AAR19268是（）。

A.水稻的DNA序列
B.水稻的蛋白质序列
C.人类的DNA序列
D.人类的蛋白质序列


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143、单项选择题  构建系统发生树，应使用（）。

A.BLAST
B.FASTA
C.UPGMA
D.FTP


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144、填空题  多序列联配的常用软件：（）


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145、填空题  初级序列数据库（）；（）和（）


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146、问答题  EST能否代表一个新的基因？为什么？


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147、名词解释  系统发育分析


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148、名词解释  HGP(human genome project)


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149、名词解释  非标度树


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150、名词解释  单基因回路


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151、填空题  识别基因主要有两个途径即（）和（）。


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152、填空题  高分值局部联配的BLAST参数是（）（高分值片段对），（）（期望值）


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153、问答题  简述最大似然法（ML）的算法思想。


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154、单项选择题  RGP是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划


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155、问答题  BLAST中，E值和P值分别是什么，它们有什么意义？


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156、多项选择题  （）是现在国际上最主要的三大核酸序列数据库

A.EMBL
B.DDBJ
C.GenBank
D.NCBI
E.EBI


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157、单项选择题  生物信息学主要是利用哪种工具实现对生命科学研究中生物信息的存储、检索和分析的？（）

A.计算机
B.iPhone
C.人造卫星
D.手机


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158、问答题  简述PCR引物设计的基本原则及其注意要点


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159、名词解释  打分矩阵（scoring matrix）


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160、名词解释  自举法检验（Bootstrap）


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161、名词解释  BLASTn


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162、问答题  蛋白质二级结构有哪些？


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163、填空题  提供蛋白质功能注释信息的数据库：（）（京都基因和基因组百科全书）和（）（蛋白质信息资源）


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164、名词解释  GenPept


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165、问答题  为什么要构建生物分子数据库。


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166、名词解释  整体联配（global alignment）


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167、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“黄瓜对不同温度逆境的抗性研究”作者的单位是（）。

A.天津市黄瓜研究所
B.中国农业科学院
C.中国科学院
D.中国农业大学


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168、名词解释  旁系同源（paralogous）


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169、名词解释  序列表谱（profile）


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170、名词解释  序列比对（alignment）


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171、单项选择题  利用中国知网文献数据库（中国知网）查找论文题目是“日光温室光温因子对黄瓜叶绿体超微结构及其功能的影响”发表的期刊是（）。

A.园艺学报
B.应用生态学报
C.生态学报
D.遗传学报


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172、名词解释  鸟枪法测序（shotgun method）


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173、问答题  简述BLAST搜索的算法思想。


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174、问答题  简述常用的引物设计软件的名称和各自特点。


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175、名词解释  E值


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176、名词解释  TrEMBL


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177、单项选择题  构建进化树工具是（）。

A.BLAST
B.ClustalW
C.Mega
D.GCG


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178、填空题  常用的三种序列格式：（）


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179、问答题  GEO数据库主要收集的是什么样的数据？


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180、单项选择题  alignment的含义是（）。

A.登录号
B.算法
C.比对
D.类推


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181、问答题  如何进行BLAST结果显著性判断？


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182、问答题  UPGMA构树法不精确的原因是什么？


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183、问答题  下列数据库分别是什么类型的数据库？


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184、单项选择题  从cDNA文库中获得的短序列是（）。

A.STS
B.UTR
C.CDS
D.EST


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185、问答题  NCBI维护的核苷酸数据库由哪几部分组成的，其主要的内容是什么？


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186、问答题  预测蛋白质三级结构的三种方法


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187、名词解释  coiled coil


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188、名词解释  生物信息学


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189、问答题  什么叫contig？


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190、问答题  简述除权配对法（UPGMA）的算法思想。


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191、名词解释  模体（motif）


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192、单项选择题  Proteomics的含义是（）。

A.生物信息学
B.基因组学
C.蛋白质组学
D.表观遗传学


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193、名词解释  最大简约法（MP）


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194、填空题  测试基因预测程序正确预测基因的能力的项目是（）（基因预测评估项目）


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195、问答题  简述邻接法（NJ）构树的算法思想。


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196、问答题  试述蛋白质三维结构预测的三类方法


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197、名词解释  聚类分析


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198、名词解释  相似性


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199、问答题  HGP选择作为研究人类的四大“模式生物“有哪些？


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200、问答题  双序列比对方法有哪些？


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201、单项选择题  TAIR（AtDB）数据库是（）。

A.线虫基因组
B.果蝇基因组
C.拟南芥数据库
D.大肠杆菌基因组


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202、名词解释  SRS(sequence retrieva l system)


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203、单项选择题  在真核生物的一个基因内含子两端，即外显子/内含子拼接边界处，其符合（）规则。

A.Kozak
B.AU…AG
C.SD
D.Poly（A）n


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204、填空题  常用的序列搜索方法：（）和（）


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205、名词解释  PubMed


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206、问答题  如何判断起始密码子？内含子？


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207、问答题  简述序列比对两种类型。


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208、名词解释  替换（substitution）


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209、名词解释  PSI-BLAST


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210、问答题  生物信息学的目标和任务？


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211、名词解释  可接受点突变（PAM）


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212、单项选择题  如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用（）。

A.NDB数据库
B.PDB数据库
C.GenBank数据库
D.SWISS-PROT数据库


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213、问答题  真核基因结构识别主要包含哪些内容？


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214、单项选择题  mRNA5′端有（）结构。

A.帽子
B.尾巴
C.帽子和尾巴
D.多聚核苷酸


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215、名词解释  表达序列标签（EST）


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216、名词解释  序列注释


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217、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“A whole-cell computational model predicts phenotype from genotype”发表在Cell期刊的（）。

A.第50卷第1期第389-391页
B.第50卷第1期第389-401页
C.第150卷第2期第389-401页
D.第125卷第2期第389-391页


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218、名词解释  权重矩阵（序列轮廓）


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219、单项选择题  PDB是蛋白质的（）。

A.分类数据库
B.结构数据库
C.模体数据库
D.结构域数据库


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220、问答题  人类基因组计划与生物信息学有什么关系？


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221、单项选择题  被誉为“生物信息学之父”的科学家是（）。

A.Dulbecco
B.Sanger
C.吴瑞
D.林华安


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222、名词解释  进化树的二歧分叉结构


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223、名词解释  系统发生（phylogeny）


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224、名词解释  MEGA(Molecular Evolutionary Genetics Analysis)


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225、单项选择题  利用PubMed文献数据查找论文“Enhancing phytoremediation through the use of transgenics and endophytes”发表的期刊是（）。

A.New  Phytol
B.Gene
C.Nature
D.Plant  Phsiol


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226、单项选择题  contig的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域


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227、名词解释  无根树


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228、名词解释  旁系（并系）同源


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229、问答题  你认为生物信息学有什么用？对你的生活、研究有影响吗？


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230、名词解释  heptad repeat


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231、问答题  生物分子数据类型有哪些？


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232、填空题  蛋白质质谱数据搜索工具：（）


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233、填空题  用于蛋白质二级结构预测的基本神经网络模型为三层的前馈网络，包括（）


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234、名词解释  邻接法（neighbor-joining method）


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235、名词解释  序列的比对


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236、单项选择题  Entrez使用几种逻辑运算符对检索关键词做最基本的限制？（）

A.1种
B.2种
C.3种
D.4种


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237、名词解释  neighbor—joining method


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238、名词解释  低复杂度区域


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239、名词解释  SCOP数据库


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240、名词解释  直系同源


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241、名词解释  DDBJ


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242、名词解释  查询序列（query sequence）


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243、填空题  二级结构的三种状态：（），（）和（）


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244、名词解释  HMM 隐马尔可夫模型


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245、问答题  简述DNA计算实现方式中，表面方式与试管方式相比具有哪些优点？


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246、问答题  简要介绍FASTA序列格式


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247、问答题  简述KEGG的PATHWAYS数据库中包括的哪6种数据库？


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248、单项选择题  ortholog的含义是（）。

A.直系同源
B.旁系同源
C.直接进化
D.间接进化


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249、问答题  简述在蛋白质三级结构预测中同源建模法的步骤。


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250、名词解释  保守序列（conserved sequence）


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251、填空题  表达序列标签是从（）中生成的一些很短的序列（300-500bp），它们代表在特定组织或发育阶段表达的基因。


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252、名词解释  分子钟（molecular clock）


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253、单项选择题  EST的含义是（）。

A.表达序列标签
B.序列标签位点
C.高通量基因组序列
D.人工合成序列


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254、单项选择题  DNA中Tm值与（）含量成正比。

A.G+A
B.G+C
C.T+C
D.A+T


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255、问答题  PCR引物设计有哪些原则？


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256、问答题  DNA双螺旋结构模型的意义


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257、问答题  TrEMBL哪两个部分？


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258、单项选择题  隐马尔科夫模型的代号是（）。

A.HMM
B.CDD
C.HTGS
D.GSS


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259、名词解释  Entrez检索系统


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260、问答题  打分矩阵有哪些？


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261、问答题  BLAST应用有哪些？


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262、名词解释  多序列比对（multiple sequence alignment）


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263、填空题  检测原核生物ORF的程序：（）


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264、单项选择题  目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是（）。

A.卡方检验
B.相关分析
C.聚类分析
D.正态性分布检验


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265、填空题  检测系统发育树可靠性的技术：（）和（）


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266、单项选择题  根据研究发现，人类基因组中真正编码蛋白质的区域仅占DNA序列的（）。

A.1-2%
B.3-5%
C.5-10%
D.10-20%


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267、单项选择题  DDBJ的含义是（）。

A.美国国家生物信息中心
B.欧洲分子生物学实验室
C.日本DNA数据库
D.中国基因组研究中心


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268、单项选择题  微卫星标记是（）。

A.RFLP
B.SNP
C.SSR
D.RAPD


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269、填空题  系统发育学的研究方法有：（）


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270、名词解释  Entrez


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271、名词解释  反式调控元件


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272、单项选择题  domain的含义是（）。

A.基序
B.跨叠克隆群
C.碱基对
D.结构域


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273、名词解释  BioPerl


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274、问答题  如何检测DNA序列中潜在的CDS？


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275、名词解释  PAM矩阵


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276、名词解释  PIR


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277、单项选择题  Bioinformatics的含义是（）。

A.生物信息学
B.基因组学
C.蛋白质组学
D.表观遗传学


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278、问答题  在基因组序列分析方面，科学家关注哪些信息？


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279、问答题  掌握蛋白质结构有什么意义？为什么要进行蛋白质结构预测？


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280、单项选择题  提交序列到GenBank中，使用的程序可以是（）。

A.Entrez
B.SRS
C.Medline
D.BankIt


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281、填空题  聚类分析方法，分为有（）


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282、问答题  分子途径和网络的特点


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283、填空题  常用系统发育分析软件：（）


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284、单项选择题  下列Fasta格式正确的是（）。

A.seq1：agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
B.>seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
C.seq1：agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
D.>seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta


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285、名词解释  promoter


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286、单项选择题  蛋白质信号肽的预测工具有（）。

A.nnpredict
B.PredictProtein
C.SingalD
D.SingalP


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287、问答题  试述SCOP蛋白质分类方案


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288、单项选择题  OMIM是（）。

A.在线人类孟德尔遗传数据库
B.国家核酸数据库
C.人类基因组计划
D.水稻基因组计划


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289、名词解释  超家族


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290、填空题  蛋白质结构域家族的数据库有：（），（）


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291、填空题  蛋白质组研究的三大关键核心技术是（）、（）、（）。


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292、问答题  生物信息学所用的方法和技术。


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293、名词解释  基因预测的从头分析


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294、名词解释  GenBank


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295、问答题  试述SWISS-PROT中的数据来源。


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296、问答题  UniGene数据库主要收集什么样的数据？


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297、问答题  以下软件的主要用途是什么？


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298、名词解释  分子途径


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299、名词解释  邻接片段


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300、单项选择题  GenBank登录号为SCU49845的序列，其DNA产度是（）。

A.1028bp
B.3028bp
C.4028bp
D.5028bp


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